РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ
ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ СОБСТВЕННОСТИ
ГОСУДАРСТВЕННАЯ РЕГИСТРАЦИЯ ПРОГРАММЫ ДЛЯ ЭВМ

Номер регистрации (свидетельства): 2016613286

Дата регистрации: 24.03.2016

Номер и дата поступления заявки: 2016610515 26.01.2016

Дата публикации: 20.04.2016
	
Авторы:
Иголкина Анна Андреевна,
Самсонова Мария Георгиевна

Правообладатель:
федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого» (ФГАОУ ВО «СПбПУ»)

Программа для ЭВМ создана по государственному контракту

государственный заказчик: Министерство образования и науки РФ

Название программы для ЭВМ:
«Программный комплекс для анализа процентного содержания типов клеток в гетерогенном образце»

Реферат:
Программа предназначена для расчета процентного содержания различных типов клеток в биологическом гетерогенном образце, для которого известен профиль экспрессии генов. Программа требует наличие обучающей выборки, то есть образцов с экспериментально полученными процентными содержаниями интересующих типов клеток. В процессе обучения алгоритм формирует маркерные для деконволюции профили экспрессии генов в отдельных типах клеток в три этапа: фильтрация шума, цензурирование, «эвристический выбор». Полученные профили используются для расчета процентных содержаний отдельных типов клеток в новых образцах с помощью линейной регрессионной модели. Реализованный в программе разработанный алгоритм позволяет расчет процентных содержаний отдельных типов клеток без учета экспериментально полученных[ профилей экспрессии в отдельных типах клеток. Такой подход провидит к устранению добавочного шума в данных и делает расчет процентных содержаний типов клеток более точным. Программа может быть использована для расчета процентного содержания отдельных типов клеток в клинических образцах (например, образцах крови или опухолевой ткани) и в учебных целях.

Тип реализующей ЭВМ: Pentium

Язык программирования: MATLAB

Вид и версия операционной системы: Windows ХР, Windows Vista, Windows 7, Windows 8

Объем программы для ЭВМ: 17 КБ