РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ
ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ СОБСТВЕННОСТИ
ГОСУДАРСТВЕННАЯ РЕГИСТРАЦИЯ ПРОГРАММЫ ДЛЯ ЭВМ

Номер регистрации (свидетельства): 2016661615

Дата регистрации: 14.10.2016

Номер и дата поступления заявки: 2016619067 23.08.2016

Дата публикации: 20.11.2016

Контактные реквизиты:
andrei.matveev@unipat.pu.ru
	
Авторы:
Гуревич Алексей Александрович,
Савельев Владислав Владимирович,
Михеенко Алла Александровна

Правообладатель:
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет" (СПбГУ)

Название программы для ЭВМ:
«Программа для визуализации качества сборки геномных последовательностей "Icarus"» (Icarus)

Реферат:
Программа применяется для визуальной оценки и анализа качества сборки геномных последовательностей. Программа имеет два варианта отображения геномных сборок: в соответствии с выравниванием контигов на референсный геном и в соответствии с размерами контигов, обеспечивая возможность оценки сборки в случае отсутствия референсного генома. Программа предоставляет подробную информацию о каждом контиге сборки и об ошибках сборки. Для детального анализа сборок программа включает возможность визуализации покрытия генома и добавления панели генов и/или оперонов. Программа адаптирована для оценки метагеномных сборок. В данный момент известно несколько геномных браузеров, но по сравнению с аналогами, программа предоставляет расширенную функциональность для анализа de novo сборок. Программа может применяться в биоинформатике.

Тип реализующей ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК

Язык программирования: Python, JavaScript

Вид и версия операционной системы: Linux; Mac OS X

Объем программы для ЭВМ: 28 Мб